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Desarrollo y validación del diagnóstico molecular de COVID 19

Nombre Abreviado Desarrollo y validación del diagnóstico molecular de COVID 19
Financiamiento COSUDE
Convocatoria PIA - ACC 2da FASE
Categoria y Convocatoria del proyecto PIA - ACC 2DA FASE
Duración Inicio: 01/12/2019 Fin: 31/12/2020
Tipo de Investigación
Datos SIGEP:
Unidad ejecutora	Programa	Sub-programa	Proyecto	Actividad
	51	0		406
Resumen del Proyecto
El desarrollo rápido de métodos de diagnóstico para la detección del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ha sido fundamental para realizar pruebas de diagnóstico molecular eficaces y confiables. La mayor parte de los métodos basados en RT-PCR en tiempo real fueron reconocidos como protocolos de referencia desde el inicio de la pandemia. Tres fueron los genes (E, N y RdRp) identificados para hacer frente al coronavirus (COVID-19), recomendando el uso del PCR dirigido al gen E, seguido de la confirmación con el gen RdRp. Desde ese entonces, una diversidad de kits diagnostico fueron comercializados para la detección SARS COV 2, sin embargo, estudios realizados de RT-PCR dirigidos a los genes E y RdRp, mostraron umbrales significativamente diferentes obteniendo, además, resultados positivos para E y negativos para RdRp, motivando esto, a buscar métodos más resolutivos. La electroforesis capilar es una herramienta de separación de ácidos nucleicos, que presenta una versatilidad de separación altamente resolutiva. La misma puede realizarse en unos minutos utilizando pequeñas cantidades de muestra, con una alta reproducibilidad,...Ver mas
El desarrollo rápido de métodos de diagnóstico para la detección del síndrome respiratorio agudo severo coronavirus 2 (SARS-CoV-2) ha sido fundamental para realizar pruebas de diagnóstico molecular eficaces y confiables. La mayor parte de los métodos basados en RT-PCR en tiempo real fueron reconocidos como protocolos de referencia desde el inicio de la pandemia. Tres fueron los genes (E, N y RdRp) identificados para hacer frente al coronavirus (COVID-19), recomendando el uso del PCR dirigido al gen E, seguido de la confirmación con el gen RdRp. Desde ese entonces, una diversidad de kits diagnostico fueron comercializados para la detección SARS COV 2, sin embargo, estudios realizados de RT-PCR dirigidos a los genes E y RdRp, mostraron umbrales significativamente diferentes obteniendo, además, resultados positivos para E y negativos para RdRp, motivando esto, a buscar métodos más resolutivos. La electroforesis capilar es una herramienta de separación de ácidos nucleicos, que presenta una versatilidad de separación altamente resolutiva. La misma puede realizarse en unos minutos utilizando pequeñas cantidades de muestra, con una alta reproducibilidad, y con un error estándar relativo de tiempo de migración menor a 0,5%. El Laboratorio de Genética Molecular del Instituto SELADIS tiene toda la capacidad técnica y científica instalada para el desarrollo de pruebas de RT-PCR en tiempo real y análisis de fragmentos por electroforesis capilar en su plataforma automatizada. En el presente trabajo pretendemos desarrollary validar una metodología de diagnóstico robusta y altamente resolutiva útil para confirmar resultados no conformes, a través de la electroforesis capilar. Ver Menos

Objetivos

Objetivo General

• Desarrollar y validar el diagnóstico molecular de covid 19 por electroforesis capilar.

Objetivos Especificos

• Identificar pacientes cuyos resultados presenten curvas de amplificación PCR cercanas al umbral límite de positividad en la prueba RT - qPCR.

• Optimizar la prueba de electroforesis capilar para la identificación SARS COV 2.

• Validar la prueba de electroforesis capilar para el diagnostico molecular de COVID 19.

Participantes

Coordinador Magda Susana Revollo Zepita

Co-cordinador

- Participantes del proyecto

Nombre	Grado Académico	Cargo	Cédula de identidad
Erick Castillo Laura	Licenciatura	Apoyo administrativo (Categoria D)
Milenka Sirpa Torrez	Egresado	Apoyo administrativo (Categoria D)
Magda Susana Revollo Zepita	Doctorado Ph.D.	Coordinador (Categoria D)
Omar Rocabado Callisaya		Investigador ()
Jorgia Callapa Rafael		Investigador ()
Marcos Ariel Conde Chipana		Investigador ()
Yashira Alejandra Cerruto Nuñez		Investigador ()

- Colaboradores del proyecto

Nombre	Grado Académico	Cargo	Cédula de identidad
Ivy Eliana Beltran Jauna [email protected]	Licenciatura	Supervisor ()

Unidades Participantes

Unidad Proponente Servicios de Laboratorio de Diagnostico e Investigación en Salud

Unidad Contraparte

+ Unidades Co-Ejecutoras

Nombre de la Unidad	Responsable de la Unidad

Lineas de Investigación