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Secuenciación del genoma completo del Coronavirus SARS-CoV-2

Financiamiento COSUDE
Convocatoria PIA - ACC 2da FASE
Categoria y Convocatoria del proyecto PIA - ACC 2DA FASE
Duración Inicio: 01/12/2019 Fin: 31/12/2020
Tipo de Investigación
Datos SIGEP:
Unidad ejecutora	Programa	Sub-programa	Proyecto	Actividad
	51	0		403
Resumen del Proyecto
El coronavirus SARS-CoV-2 causa el síndrome respiratorio agudo severo conocido como COVID-19. La gravedad de ésta enfermedad ha generado pérdidas de varios millones de dólares para la economía de todo el mundo. Este virus que se detectó por primera vez en Wuhan, China en Diciembre del 2019 y desde entonces ya ha mutado varias veces y al momento se observan 31 linajes. En este proyecto se secuenciará el genoma completo del Coronavirus (SARS-CoV-2) presente en Bolivia y las variantes que están circulando. Para esto se secuenciarán muestras de ARN de los primeros pacientes infectados que llegaron al país. Posteriormente se secuenciaran 12 muestras a los 6 y 12 meses del inicio de la pandemia para realizar la vigilancia epidemiológica molecular. La secuenciación del genoma completo del coronavirus SARS-CoV-2 en Bolivia se realizará mediante secuenciación NGS de muestras de ARN con tecnología de Nanoporos. El análisis bioinformático y almacenamiento de datos se realizará en el servidor CnCaBo de la UMSA.Se alineará las secuencias de los coronavirus a los genomas de la...Ver mas
El coronavirus SARS-CoV-2 causa el síndrome respiratorio agudo severo conocido como COVID-19. La gravedad de ésta enfermedad ha generado pérdidas de varios millones de dólares para la economía de todo el mundo. Este virus que se detectó por primera vez en Wuhan, China en Diciembre del 2019 y desde entonces ya ha mutado varias veces y al momento se observan 31 linajes. En este proyecto se secuenciará el genoma completo del Coronavirus (SARS-CoV-2) presente en Bolivia y las variantes que están circulando. Para esto se secuenciarán muestras de ARN de los primeros pacientes infectados que llegaron al país. Posteriormente se secuenciaran 12 muestras a los 6 y 12 meses del inicio de la pandemia para realizar la vigilancia epidemiológica molecular. La secuenciación del genoma completo del coronavirus SARS-CoV-2 en Bolivia se realizará mediante secuenciación NGS de muestras de ARN con tecnología de Nanoporos. El análisis bioinformático y almacenamiento de datos se realizará en el servidor CnCaBo de la UMSA.Se alineará las secuencias de los coronavirus a los genomas de la base de datos mundial asignará a su linaje correspondiente para poder rastrear el origen geográfico de las variantes que llegaron al país. Asignar las variantes que circulan en Bolivia también contribuirá a revelar las variantes presentes en los distintos departamentos del país. Se comparara los genomas de las 12 variantes originales con las variantes encontradas a los 6 y 12 meses para evaluar la aparición de mutaciones y nuevos linajes. Realizar la comparación genómica de las variantes contribuirá a conocer factores de riesgo asociados a las variantes del coronavirus como su patogenicidad, virulencia e inmunogenicidad que podrían revelar la aparición de una nueva cepa y un posible nuevo rebrote de la enfermedad. Además, a través de la vigilancia epidemiológica molecular podremos observar la evolución del SARS-CoV-2 en tiempo real. Ver Menos

Objetivos

Objetivo General

• Determinar las variantes de Coronavirus (SARS-CoV-2) presentes en Bolivia y los factores de riesgo en la enfermedad COVID-19 asociados a éstos.

Objetivos Especificos

• Determinar la secuencia de nucleótidos genómicos de los primeros Coronavirus (SARS-CoV-2) que ingresaron a Bolivia.

• Identificar los lineajes de SARS-CoV-2 a los que pertenecen las variantes del Coronavirus presentes en Bolivia y determinar su origen geográfico.

• Identificar nuevos factores de riesgo y prevenir oportunamente nuevos rebrotes de COVID-19 mediante epidemiologia molecular del SARS-CoV-2.

Participantes

Coordinador Aneth Vasquez Michel

Co-cordinador

- Participantes del proyecto

Nombre	Grado Académico	Cargo	Cédula de identidad
Milenka Sirpa Torrez	Egresado	Apoyo administrativo (Categoria D)
Oscar Miguel Rollano Peñaloza	Maestria	Co-coordinador ()
Aneth Vasquez Michel	Maestria	Coordinador (Categoria D)

- Colaboradores del proyecto

Nombre	Grado Académico	Cargo	Cédula de identidad
Ivy Eliana Beltran Jauna [email protected]	Licenciatura	Supervisor ()

Unidades Participantes

Unidad Proponente Servicios de Laboratorio de Diagnostico e Investigación en Salud Instituto de Investigaciones Químicas

Unidad Contraparte

+ Unidades Co-Ejecutoras

Nombre de la Unidad	Responsable de la Unidad

Lineas de Investigación